MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 125239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017271	CTG	2	6	31	36	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017271	TGGA	2	8	69	76	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017271	GC	3	6	166	171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017271	CAGC	2	8	174	181	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017271	GAT	2	6	186	191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017271	GATG	2	8	200	207	25 %	25 %	50 %	0 %	384425692
7	NC_017271	CCCG	2	8	245	252	0 %	0 %	25 %	75 %	384425692
8	NC_017271	CGGT	2	8	418	425	0 %	25 %	50 %	25 %	384425692
9	NC_017271	CGG	2	6	481	486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425692
10	NC_017271	GCA	2	6	556	561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425692
11	NC_017271	TGC	2	6	628	633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425692
12	NC_017271	GCA	2	6	640	645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425692
13	NC_017271	CGGC	2	8	676	683	0 %	0 %	50 %	50 %	384425692
14	NC_017271	GCC	2	6	708	713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425692
15	NC_017271	TTC	2	6	741	746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425692
16	NC_017271	GAT	2	6	752	757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425692
17	NC_017271	CG	3	6	759	764	0 %	0 %	50 %	50 %	384425692
18	NC_017271	CAG	2	6	804	809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425692
19	NC_017271	GCT	2	6	818	823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425692
20	NC_017271	CGA	2	6	827	832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425692
21	NC_017271	CGCA	2	8	858	865	25 %	0 %	25 %	50 %	384425692
22	NC_017271	GCC	2	6	904	909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425692
23	NC_017271	ATC	2	6	915	920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425692
24	NC_017271	CG	3	6	940	945	0 %	0 %	50 %	50 %	384425692
25	NC_017271	CCG	2	6	1011	1016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425692
26	NC_017271	GCG	2	6	1032	1037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425692
27	NC_017271	GC	3	6	1053	1058	0 %	0 %	50 %	50 %	384425692
28	NC_017271	GCG	2	6	1063	1068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425692
29	NC_017271	CGA	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425692
30	NC_017271	AAG	2	6	1104	1109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425692
31	NC_017271	TGG	2	6	1153	1158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425692
32	NC_017271	TGCG	2	8	1225	1232	0 %	25 %	50 %	25 %	384425692
33	NC_017271	CAG	3	9	1233	1241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425692
34	NC_017271	AGA	2	6	1264	1269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425692
35	NC_017271	ACT	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425692
36	NC_017271	GC	3	6	1335	1340	0 %	0 %	50 %	50 %	384425692
37	NC_017271	GCCG	2	8	1413	1420	0 %	0 %	50 %	50 %	384425692
38	NC_017271	ACCAC	2	10	1423	1432	40 %	0 %	0 %	60 %	384425692
39	NC_017271	TGC	2	6	1435	1440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425692
40	NC_017271	A	6	6	1559	1564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017271	TGCGGC	2	12	1609	1620	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017271	CCG	2	6	1727	1732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017271	CAC	2	6	1749	1754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017271	GGT	2	6	1852	1857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425693
45	NC_017271	GTC	2	6	1862	1867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
46	NC_017271	AAC	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425693
47	NC_017271	GACC	2	8	1942	1949	25 %	0 %	25 %	50 %	384425693
48	NC_017271	CG	3	6	2014	2019	0 %	0 %	50 %	50 %	384425693
49	NC_017271	CCTG	2	8	2044	2051	0 %	25 %	25 %	50 %	384425693
50	NC_017271	CAG	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425693
51	NC_017271	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384425693
52	NC_017271	CTG	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
53	NC_017271	CTG	2	6	2297	2302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
54	NC_017271	TG	3	6	2306	2311	0 %	50 %	50 %	0 %	384425693
55	NC_017271	ATC	2	6	2381	2386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425693
56	NC_017271	GCT	2	6	2410	2415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
57	NC_017271	CTG	2	6	2420	2425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
58	NC_017271	GGC	2	6	2428	2433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425693
59	NC_017271	GAGCTG	2	12	2447	2458	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384425693
60	NC_017271	GCG	2	6	2484	2489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425693
61	NC_017271	TCACCT	2	12	2493	2504	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384425693
62	NC_017271	GC	3	6	2593	2598	0 %	0 %	50 %	50 %	384425693
63	NC_017271	GCG	2	6	2612	2617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425693
64	NC_017271	CGAA	2	8	2625	2632	50 %	0 %	25 %	25 %	384425693
65	NC_017271	GC	3	6	2682	2687	0 %	0 %	50 %	50 %	384425693
66	NC_017271	GAA	2	6	2702	2707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425693
67	NC_017271	GAT	2	6	2741	2746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425693
68	NC_017271	CTG	2	6	2774	2779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
69	NC_017271	CGA	2	6	2800	2805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425693
70	NC_017271	TCG	2	6	2837	2842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
71	NC_017271	CAG	2	6	2860	2865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425693
72	NC_017271	CGT	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
73	NC_017271	T	6	6	2951	2956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017271	CGCA	2	8	3118	3125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017271	TGA	2	6	3134	3139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017271	G	7	7	3171	3177	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017271	TGGC	2	8	3196	3203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017271	CT	3	6	3252	3257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017271	CGG	2	6	3302	3307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017271	CT	3	6	3321	3326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017271	TGG	2	6	3526	3531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017271	GCC	2	6	3656	3661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017271	CGC	2	6	3701	3706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017271	TGC	2	6	3721	3726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017271	CGAT	2	8	3793	3800	25 %	25 %	25 %	25 %	384425694
86	NC_017271	TCCA	2	8	3817	3824	25 %	25 %	0 %	50 %	384425694
87	NC_017271	TCG	2	6	3831	3836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425694
88	NC_017271	CCAG	2	8	3859	3866	25 %	0 %	25 %	50 %	384425694
89	NC_017271	TCG	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425694
90	NC_017271	GCC	2	6	4094	4099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425694
91	NC_017271	TG	3	6	4133	4138	0 %	50 %	50 %	0 %	384425694
92	NC_017271	GGT	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425694
93	NC_017271	GGC	2	6	4192	4197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425694
94	NC_017271	CGG	2	6	4204	4209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425694
95	NC_017271	ACGC	2	8	4271	4278	25 %	0 %	25 %	50 %	384425694
96	NC_017271	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425694
97	NC_017271	GCTG	2	8	4350	4357	0 %	25 %	50 %	25 %	384425694
98	NC_017271	CTGG	2	8	4478	4485	0 %	25 %	50 %	25 %	384425694
99	NC_017271	CTG	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425694
100	NC_017271	GCCT	2	8	4654	4661	0 %	25 %	25 %	50 %	384425694
101	NC_017271	GGA	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425694
102	NC_017271	GCG	2	6	4694	4699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425694
103	NC_017271	GAT	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425694
104	NC_017271	TCA	3	9	4746	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425694
105	NC_017271	GC	3	6	4781	4786	0 %	0 %	50 %	50 %	384425694
106	NC_017271	C	6	6	4819	4824	0 %	0 %	0 %	100 %	384425694
107	NC_017271	GCC	3	9	4891	4899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425694
108	NC_017271	CCG	2	6	4907	4912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017271	CG	3	6	4964	4969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017271	CCG	2	6	4979	4984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017271	CGTG	2	8	4989	4996	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017271	CGA	2	6	5024	5029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
113	NC_017271	TGC	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425695
114	NC_017271	ACG	2	6	5140	5145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
115	NC_017271	CAC	2	6	5157	5162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425695
116	NC_017271	GGT	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425695
117	NC_017271	CGA	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
118	NC_017271	GAA	2	6	5301	5306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425695
119	NC_017271	TGC	2	6	5338	5343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425695
120	NC_017271	CGG	2	6	5348	5353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425695
121	NC_017271	ACA	2	6	5365	5370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425695
122	NC_017271	CGG	2	6	5384	5389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425695
123	NC_017271	GGT	2	6	5411	5416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425695
124	NC_017271	CAG	2	6	5472	5477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
125	NC_017271	CAC	2	6	5540	5545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425695
126	NC_017271	CGG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425695
127	NC_017271	GC	3	6	5607	5612	0 %	0 %	50 %	50 %	384425695
128	NC_017271	CGA	2	6	5663	5668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
129	NC_017271	GCG	2	6	5671	5676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425695
130	NC_017271	CGA	2	6	5687	5692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
131	NC_017271	GTG	2	6	5799	5804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425695
132	NC_017271	CAA	2	6	5858	5863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425695
133	NC_017271	GGC	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425695
134	NC_017271	CG	3	6	5917	5922	0 %	0 %	50 %	50 %	384425695
135	NC_017271	CGA	2	6	5984	5989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
136	NC_017271	CGG	2	6	6088	6093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425695
137	NC_017271	GC	3	6	6111	6116	0 %	0 %	50 %	50 %	384425695
138	NC_017271	CGAA	2	8	6142	6149	50 %	0 %	25 %	25 %	384425695
139	NC_017271	TCG	2	6	6172	6177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425695
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141	NC_017271	GC	3	6	6210	6215	0 %	0 %	50 %	50 %	384425695
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143	NC_017271	GC	3	6	6235	6240	0 %	0 %	50 %	50 %	384425695
144	NC_017271	TCG	2	6	6313	6318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425695
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259	NC_017271	GC	3	6	10187	10192	0 %	0 %	50 %	50 %	384425698
260	NC_017271	TCA	2	6	10282	10287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425698
261	NC_017271	ACCT	2	8	10329	10336	25 %	25 %	0 %	50 %	384425698
262	NC_017271	TAC	3	9	10353	10361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425698
263	NC_017271	GCC	2	6	10401	10406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425698
264	NC_017271	C	6	6	10405	10410	0 %	0 %	0 %	100 %	384425698
265	NC_017271	TGC	2	6	10450	10455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425698
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267	NC_017271	A	6	6	10518	10523	100 %	0 %	0 %	0 %	384425698
268	NC_017271	AAG	2	6	10536	10541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425698
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270	NC_017271	A	7	7	10558	10564	100 %	0 %	0 %	0 %	384425698
271	NC_017271	ATC	2	6	10669	10674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_017271	AAC	2	6	10720	10725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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